因美方參與臺美生態學校夥伴計畫之名額有限，若我國參加生態夥伴學校申請數量較多，則依據申請文件之生態行動團隊英語能力、學校推動成為生態學校之目標與願景、學校推動成為生態學校之現況或推動環境教育之具體作為及其他特殊事蹟等四項評分指標進行遴選。